因为公司知道自己怀孕了，然后说公司规定怀孕期间不能上班，然后申请辞职

您提到的公司规定怀孕期间不能上班的情况，可能违反了《中华人民共和国劳动法》的相关规定。根据该法，用人单位的规章制度不能违反法律、法规的规定，损害劳动者权益。而《女职工劳动保护特别规定》也明确指出，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。因此，公司这样的规定是违法的，您有权拒绝辞职并要求继续履行劳动合同。
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若公司坚持要求您辞职，您可以采取以下措施：首先，与公司沟通，指出其规定违法，要求继续履行合同；其次，保留好所有与公司的沟通记录，包括书面和口头的；最后，如果公司仍然不改正，您可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
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从法律角度，您可以采取以下措施保障自己的权益：了解并熟悉相关法律法规，如《劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》；与公司进行友好沟通，明确表达您希望继续履行劳动合同的意愿；保留好所有与公司的沟通记录和劳动合同等相关证据；如遇公司违法行为，及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，必要时提起劳动仲裁或诉讼。